OsloMets veiledning for bruk av Colossus

Denne veiledningen er utviklet for forskere ved OsloMet innen samfunnsvitenskap, sosiologi, helsevitenskap og andre fagområder som arbeider med store datasett og derfor har behov for å kjøre beregningstunge analyser på Colossus, TSD (Tjenester for sensitive data - som leveres fra Universitetet i Oslo - UiO (uio.no))

Veiledningen er ment som et supplement til eksisterende Colossus-veiledninger hos UiO (uio.no), og går gjennom de konkrete tekniske stegene – inkludert klargjøring av filer, oppsett av SLURM‑jobber og kjøring av analyser. To egne veiledninger er utarbeidet: én for STATA og én for R.

Hvordan bruke veiledningen?

Start gjerne med å se veiledningsvideoene først, deretter kan du bruke veiledningen som en oppskrift på alt som skal klargjøres av kommandoer og filer.

Kontakt

Har du spørsmål, mangler du funksjonalitet eller ønsker du å foreslå forbedringer, kontakt:

IT-støtte til forskning (oslomet.pureservice.no)

Veiledningene er utviklet i samarbeid mellom forskere ved OsloMet, IT‑avdelingen og kompetanseutviklingsprosjektet RegRock.

Tilgang til TSD og Colossus

OsloMet har inngått tjeneste- og databehandleravtale for bruk av TSD. Om hvordan man som OsloMet-bruker kan få tilgang til TSD og dermed Colossus, gå til OsloMets egen nettside om bruk av Tjenester for sensitive data (oslomet.no).

Forslag til arbeidsflyt

En anbefalt arbeidsflyt finner du i avslutningen av veiledningen for STATA (gjelder også R) og kan brukes som sjekkliste før du sender jobber til Colossus.

Takk til

En særlig takk rettes til: Trine Holten, Ida Drange, Karine Fluge Ulleberg, samt flere bidragsytere

Uten samarbeidet mellom forskere, IT‑avdelingen og kompetanseutviklingsprosjektet RegRock, hadde ikke denne veiledningen blitt utviklet i dette formatet.